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Arraystar AS-NM-004說明書

更新時(shí)間:2018-08-07      點(diǎn)擊次數(shù):1866

 

Arraystar致力于幫助生物醫(yī)學(xué)科學(xué)研究人員了解監(jiān)管非編碼RNA(ncRNAs),這已成為21世紀(jì)生物醫(yī)學(xué)研究中吸引力和挑戰(zhàn)性的方面之一。這些非編碼RNA類包括lncRNA,環(huán)狀RNA,微小RNA,tRNA,tRF,tiRNA,snoRNA等。自2009年成立以來,我們在ncRNA研究領(lǐng)域的創(chuàng)新產(chǎn)品,深入的實(shí)驗(yàn)專業(yè)知識(shí)和強(qiáng)大的生物信息學(xué)支持了數(shù)百種高影響力的出版物。多年來,我們的客戶群已擴(kuò)展到數(shù)千個(gè)研究機(jī)構(gòu)。 

超越RNA

隨著新型非編碼RNA的發(fā)現(xiàn)及其超出蛋白質(zhì)編碼轉(zhuǎn)錄本的調(diào)控活性,RNA生物學(xué)領(lǐng)域的研究意味著超越編碼信使RNA,這是中心法則的重點(diǎn)。揭示新型ncRNA的關(guān)鍵作用的追求引起了強(qiáng)烈的科學(xué)興趣,具有發(fā)現(xiàn)新的疾病調(diào)節(jié)劑,新的生物標(biāo)志物和治療靶標(biāo)的誘人機(jī)會(huì)。雖然基因表達(dá)分析行業(yè)仍主要僅涵蓋mRNA,但Arraystar正在邁向新的道路并向前邁進(jìn)。 

焦點(diǎn)

除了傳統(tǒng)的mRNA表達(dá)分析之外,Arraystar的愿景還集中在長和小的非編碼RNA類的轉(zhuǎn)錄組范圍分析,每個(gè)類具有不同的RNA特性和生物活性,需要更專業(yè)的方法和生物信息學(xué)來分析:

•lncRNAs 
•環(huán)狀RNAs 
•tRNAs 
•tRFs和tiRNAs 
•snoRNAs 
•microRNAs及其靶mRNA 
•piRNAs 

NuRNA™中樞代謝PCR陣列(H)

NuRNA™ Central Metabolism PCR Array (H)

Product Name

Catalog No

Size

NuRNA™ Human Central Metabolism PCR Array

AS-NM-004-1

384-well plate

NuRNA™ Human Central Metabolism PCR Array (Roche Light Cycler 480)

AS-NM-004-1-R

384-well plate

 

Arraystar NuRNA™人類中樞代謝PCR陣列系統(tǒng)地描述編碼細(xì)胞代謝中的酶或蛋白質(zhì)的373個(gè)轉(zhuǎn)錄物的表達(dá)。該小組涵蓋核心代謝途徑和代謝物轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng),如糖酵解,TCA循環(huán),脂肪酸生物合成和核苷酸代謝。Array是研究癌癥,生理學(xué),表觀遺傳學(xué)和疾病中代謝調(diào)節(jié)的方便而有力的工具。

優(yōu)點(diǎn)
•*覆蓋率 - 系統(tǒng)地涵蓋核心代謝途徑和關(guān)鍵代謝物轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)中的酶和蛋白質(zhì)成分
•詳細(xì)注釋 - 通過將基因組/轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)與蛋白質(zhì)UniProt貶低相結(jié)合,每個(gè)代謝基因都注釋了功能蛋白質(zhì)或蛋白質(zhì)亞基的信息。 。
•選擇具有代表性的轉(zhuǎn)錄物 - 檢測編碼Uniprot貶低中經(jīng)典蛋白質(zhì)/亞基序列的mRNA轉(zhuǎn)錄本
•嚴(yán)謹(jǐn) - 所有測定都經(jīng)過精心優(yōu)化和嚴(yán)格驗(yàn)證 
•方便 - 即用,準(zhǔn)確的分析,快速結(jié)果。

我們建議 在運(yùn)行NuRNA™中央代謝PCR陣列時(shí)使用我們的  rtStar™First-Strand cDNA合成試劑盒  (AS-FS-001)  和  ArraystarSYBR®GreenReal-time qPCR Master Mix,以獲得*性能。

產(chǎn)品設(shè)計(jì)背景

代謝是活細(xì)胞的基礎(chǔ),并影響所有細(xì)胞功能。代謝途徑結(jié)構(gòu)與細(xì)胞條件有很大差異,例如細(xì)胞生長,增殖,分化和死亡[1,2],這主要由細(xì)胞類型的功能和環(huán)境決定。包括信號(hào)通路在內(nèi)的多種機(jī)制調(diào)節(jié)代謝,相應(yīng)地,代謝改變可以作為信號(hào)并獨(dú)立地重組細(xì)胞[3]。zui近的發(fā)現(xiàn)揭示了多種細(xì)胞過程的代謝控制,如表觀遺傳[4,5],自噬[6,7],細(xì)胞凋亡和調(diào)節(jié)性壞死[8]。異常代謝是一些zui普遍的疾病的潛在原因,如肥胖,糖尿病和癌癥(圖1)。在細(xì)胞水平,增殖或癌細(xì)胞特征性地重新連接信號(hào)并重新編程代謝途徑以滿足持續(xù)的合成代謝高需求(圖2)。系統(tǒng)地了解這些疾病的代謝變化將大大推進(jìn)背后的科學(xué),識(shí)別代謝生物標(biāo)志物并設(shè)計(jì)新的治療目標(biāo)。

 

圖1.細(xì)胞過程的代謝影響和與疾病的關(guān)聯(lián)。

Arraystar NuRNA™人類中樞代謝PCR陣列專門設(shè)計(jì)用于快速方便地表達(dá)373個(gè)轉(zhuǎn)錄本的表達(dá)譜,用于核心代謝途徑和關(guān)鍵代謝物轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)中的酶和蛋白質(zhì)。它是新陳代謝研究中假設(shè)驅(qū)動(dòng)和探索性分析的系統(tǒng)而有力的工具。該陣列涵蓋核心代謝途徑和代謝物轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng),包括葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,糖酵解,TCA循環(huán),甘油/脂肪酸/膽固醇合成,乳酸生產(chǎn)和轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,糖異生,糖原代謝,己糖胺代謝,戊糖磷酸途徑,絲氨酸/甘氨酸/一 - 碳代謝,谷氨酰胺轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白和谷氨酰胺解,氧化還原平衡/ GSH合成,脂肪酸氧化,乙酸代謝和核苷酸代謝。每個(gè)測定都在許多組織和細(xì)胞系中得到嚴(yán)格驗(yàn)證。為了確保zui高的數(shù)據(jù)質(zhì)量,該陣列包括Spike-in控制,陽性PCR控制,基因組DNA控制和標(biāo)準(zhǔn)化參考。 

 





圖2.癌癥代謝的示意圖。

 

參考

1.Agathocleous,M。和Harris,WA(2013)生理細(xì)胞增殖和分化中的代謝。趨勢細(xì)胞生物學(xué),23(10):484-92 [PMID:23756093] 2.Green 
,DR,et al。(2014)細(xì)胞生物學(xué)。代謝控制細(xì)胞死亡。Science,345(6203):1250256 [PMID:25237106] 3.Metallo 
,CM和Vander Heiden,MG(2013)了解代謝調(diào)節(jié)及其對細(xì)胞生理學(xué)的影響。Mol Cell,49(3):388-98 [PMID:23395269] 4.Lu 
,C。和Thompson,CB(2012)表觀遺傳學(xué)的代謝調(diào)節(jié)。Cell Metab,16(1):9-17 [PMID:22768835] 
5. Kinnaird,A.,et al。(2016)代謝控制癌癥中的表觀遺傳學(xué)。Nat Rev Cancer,16(11):694-707 [PMID:27634449]
6. Galluzzi,L.,et al。(2014)自噬的代謝控制。Cell,159(6):1263-76 [PMID:25480292] 
7. Kaur,J。和Debnath,J。(2015)自噬在分解代謝和合成代謝的十字路口。Nat Rev Mol Cell Biol,16(8):461-72 [PMID:26177004] 8.Vanden 
Berghe,T.,et al。(2014)調(diào)節(jié)壞死:非凋亡細(xì)胞死亡途徑的擴(kuò)展網(wǎng)絡(luò)。Nat Rev Mol Cell Biol,15(2):135-47 [PMID:24452471]

 

 

 

 

Arraystar 2018年產(chǎn)品列表

 

貨號(hào)

品名

規(guī)格

品牌

AS-FS-005

rtStar™ tRF&tiRNA Pretreatment Kit

12 reactions

arraystar

AS-NR-004-1

nrStar™ Human Functional LncRNA PCR Array

384-well/ plate

arraystar

AS-NR-004-1-R

nrStar™ Human Functional LncRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well/ plate

arraystar

AS-NR-004M-1

nrStar™ Mouse Functional LncRNA PCR Array

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-004M-1-R

nrStar™ Mouse Functional LncRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NM-001-1

NuRNA™ Human tRNA Modification Enzymes PCR Array

384 (4x96)-well plate

arraystar

AS-NM-001-1-R

NuRNA™ Human tRNA Modification Enzymes PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384 (4x96)-well plate

arraystar

AS-NM-002-1

NuRNA™ Human Small RNA Biogenesis Proteins PCR Array

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NM-002-1-R

NuRNA™ Human Small RNA Biogenesis Proteins PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NM-003-1

NuRNA™ Human Epitranscriptomics PCR Array

384 (4x96)-well plate

arraystar

AS-NM-003-1-R

NuRNA™ Human Epitranscriptomics PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384 (4x96)-well plate

arraystar

AS-NM-004-1

NuRNA™ Human Central Metabolism PCR Array

384-well plate

arraystar

AS-NM-004-1-R

NuRNA™ Human Central Metabolism PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well plate

arraystar

AS-NR-001H-1

nrStar™ Human tRNA PCR Array V2.0

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-001H-1-R

nrStar™ Human tRNA PCR Array V2.0 (Roche Light Cycler 480)

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-001M-1

nrStar™ Mouse tRNA PCR Array

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-001M-1-R

nrStar™ Mouse tRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-001-1

nrStar™ Human tRNA PCR Array V1.0

384-well (4*96) / plate

arraystar

AS-MB-001

Seq-Star™ rRNA Removal Kit

Human/Mouse/Rat NGS RNA-Seq library preparation

arraystar

AS-MB-006-01

Seq-Star™ poly(A) mRNA Isolation Kit

24 reactions

arraystar

AS-MB-006-02

Seq-Star™ poly(A) mRNA Isolation Kit

96 reactions

arraystar

AS-MB-009

Seq-Star™ RNAClean and smallEnrich Beads

10mL

arraystar

AS-MB-009

Seq-Star™ RNAClean and smallEnrich Beads

10mL

arraystar

AS-MB-007

Seq-Star™ DNAClean Beads

50mL

arraystar

AS-MB-008-01

Seq-Star™ DNA Size Selection Kit

24 reactions

arraystar

AS-MB-008-02

Seq-Star™ DNA Size Selection Kit

96 reactions

arraystar

AS-MB-010-01

Seq-Star™ Rapid DNA-seq Kit (Illumina, SetA)

Adapter Barcode(1-12)

arraystar

AS-MB-010-02

Seq-Star™ Rapid DNA-seq Kit (Illumina, SetB)

Adapter Barcode(13-24)

arraystar

AS-MB-012-01

Seq-Star™ Small RNA-seq Kit (Illumina, setA)

Adapter Barcode(1-12)

arraystar

AS-MB-012-02

Seq-Star™ Small RNA-seq Kit (Illumina, setB)

Adapter Barcode(13-24)

arraystar

AS-MB-013-01

Seq-Star™ Rapid RNA-Seq Kit (Illumina, setA)

24 reactions

arraystar

AS-MB-013-02

Seq-Star™ Rapid RNA-Seq Kit (Illumina, setB)

24 reactions

arraystar

AS-PACK-001-A

Seq-Star™ Rapid RNA-Seq Library Prep Package A – Illumina

12 reactions

arraystar

AS-PACK-001-B

Seq-Star™ Rapid RNA-Seq Library Prep Package B – Illumina

12 reactions

arraystar

AS-MR-005-5

Arraystar SYBR® Green qPCR Master Mix(ROX-), 5mL

5mL

arraystar

AS-MR-005-25

Arraystar SYBR® Green qPCR Master Mix(ROX-), 25mL

25mL

arraystar

AS-MR-006-5

Arraystar SYBR® Green qPCR Master Mix(ROX+), 5mL

5mL

arraystar

AS-MR-006-25

Arraystar SYBR® Green qPCR Master Mix(ROX+), 25mL

25mL

arraystar

AS-FS-001

rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit

12 reactions

arraystar

AS-FS-002

rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit (3’ adaptor)

12 reactions

arraystar

AS-FS-003

rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit (3’ and 5’ adaptor)

6 reactions

arraystar

AS-FS-003-02

rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit (3’ and 5’ adaptor)

12 reactions

arraystar

AS-FS-004

rtStar™ tRNA-optimized First-Strand cDNA Synthesis Kit

12 reactions

arraystar

AS-FS-005

rtStar™ tRF&tiRNA Pretreatment Kit

12 reactions

arraystar

AS-NR-002-1-M

rtStar™ Pre-designed Human tRF&tiRNA Primer Sets

100 reactions

arraystar

AS-NR-001-1-M

rtStar™ Pre-designed Human tRNA Primer Sets

100 reactions

arraystar

AS-NR-001M-1-M

rtStar™ Pre-designed Mouse tRNA Primer Sets

100 reactions

arraystar

AS-NR-004-1-M

rtStar™ Pre-designed Human Functional LncRNA Primer Sets

100 reactions

arraystar

AS-NR-002-1

nrStar™ Human tRF&tiRNA PCR Array

384-well(2*192) / plate

arraystar

AS-NR-002-1-R

nrStar™ Human tRF&tiRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-002M-1

nrStar™ Mouse tRF PCR Array

384-well (4*96) / plate

arraystar

AS-NR-002M-1-R

nrStar™ Mouse tRF PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well (4*96) / plate

arraystar

AS-NR-003-1

nrStar™ Human snoRNA PCR Array

384 well / plate

arraystar

AS-NR-003-1-R

nrStar™ Human snoRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384 well / plate

arraystar

 

 

 

 

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